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Research themes

 

Projekt A11

 

Mechanistische Studien zur Oxidativen DNA-Demethylierung und neue lichtschaltbare Peptide für biologische Anwendungen

 

In diesem Teilprojekt sind Studien zum (i) Mechanismus der enzymatischen oxidativen DNA-Demethylierung sowie (ii) zur Entwicklung neuer lichtschaltbarer Peptide für biologische Anwendungen geplant. Dazu wollen wir spezifisch fluorierte Nukleoside der neuen epigenetischen Basen 5mC, 5hmC, 5fC und 5caC herstellen und in Form kurzer modifizierter DNA-Fragmente als Sonden für die Aufklärung des Reaktionsmechanismus der Demethylierung von DNA durch TET-Enzyme nutzen. Zudem planen wir die Entwicklung photoschaltbarer Azobenzol-basierter Derivate von INF-Fusionspeptiden sowie des Atrial-Natriuretischen Peptids (ANP).

 

Project A11

 

Mechanistic studies of oxidative DNA demethylation and novel photoswitchable peptides for biological applications

 

In this project, we plan to pursue studies (i) on the mechanism of the oxidative enzymatic demethylation of DNA and (ii) the development of novel photoswitchable peptides for biological applications. Therefore, we will synthesize specifically fluorinated nucleosides of the novel epigenetic bases 5mC, 5hmC, 5fC and 5caC and incorporate them into short DNA fragments as probes for investigations on the mechanism of DNA demethylation by TET enzymes. Besides, we will develop photoswitchable azobenzene-based derivatives of INF fusion peptides and of the atrial natriuretic peptide ANF.